Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pkd2l2Q9JLG4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2l2Q9JLG4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms