Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgm1Q9JLF6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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Tgm1Q9JLF6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Tgm1Q9JLF6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms