Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SacsQ9JLC8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SacsQ9JLC8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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