Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CubnQ9JLB4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CubnQ9JLB4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CubnQ9JLB4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms