Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rfx5Q9JL61 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx5Q9JL61 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx5Q9JL61 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx5Q9JL61 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms