Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot9Q9JKY0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms