Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Upk3aQ9JKX8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upk3aQ9JKX8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms