Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrac1Q9JKP8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms