Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx6Q9JKK1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx6Q9JKK1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms