Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mrpl39Q9JKF7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl39Q9JKF7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.5 ms