Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap4m1Q9JKC7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap4m1Q9JKC7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap4m1Q9JKC7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap4m1Q9JKC7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ap4m1Q9JKC7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms