Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pard6bQ9JK83 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms