Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msgn1Q9JK54 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msgn1Q9JK54 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msgn1Q9JK54 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms