Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrip3Q9JJR9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrip3Q9JJR9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrip3Q9JJR9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrip3Q9JJR9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrip3Q9JJR9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms