Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 379.6 ms