Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcc1Q9JJF6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcc1Q9JJF6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms