Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc86Q9JJ89 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms