Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smad9Q9JIW5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Smad9Q9JIW5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms