Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl1Q9JI74 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl1Q9JI74 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms