Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EefsecQ9JHW4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EefsecQ9JHW4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EefsecQ9JHW4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EefsecQ9JHW4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EefsecQ9JHW4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EefsecQ9JHW4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EefsecQ9JHW4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EefsecQ9JHW4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EefsecQ9JHW4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EefsecQ9JHW4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EefsecQ9JHW4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EefsecQ9JHW4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms