Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcirg1Q9JHF5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tcirg1Q9JHF5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms