Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc5a4aQ9ET37 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms