Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc17Q9ESX4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc17Q9ESX4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms