Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Brd4Q9ESU6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Brd4Q9ESU6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Brd4Q9ESU6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms