Protein–RNA interactions for Protein: Q9EST8

Nfkbiz, NF-kappa-B inhibitor zeta, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbizQ9EST8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfkbizQ9EST8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfkbizQ9EST8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfkbizQ9EST8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms