Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr9Q9EQU3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr9Q9EQU3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms