Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr6Q9EQ16 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Cxcr6Q9EQ16 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cxcr6Q9EQ16 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cxcr6Q9EQ16 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cxcr6Q9EQ16 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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