Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rpgrip1Q9EPQ2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms