Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sil1Q9EPK6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sil1Q9EPK6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sil1Q9EPK6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms