Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Aph1cQ9DCZ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Aph1cQ9DCZ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Aph1cQ9DCZ9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Aph1cQ9DCZ9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Aph1cQ9DCZ9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Aph1cQ9DCZ9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Aph1cQ9DCZ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Aph1cQ9DCZ9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Aph1cQ9DCZ9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Aph1cQ9DCZ9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms