Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnft1Q9DCN7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnft1Q9DCN7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft1Q9DCN7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft1Q9DCN7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft1Q9DCN7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft1Q9DCN7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft1Q9DCN7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft1Q9DCN7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft1Q9DCN7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft1Q9DCN7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnft1Q9DCN7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms