Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ndufa8Q9DCJ5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndufa8Q9DCJ5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa8Q9DCJ5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms