Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syvn1Q9DBY1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Syvn1Q9DBY1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syvn1Q9DBY1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms