Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf6Q9DBU5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf6Q9DBU5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.9 ms