Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc97Q9DBT3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc97Q9DBT3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms