Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
March8Q9DBD2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
March8Q9DBD2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
March8Q9DBD2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
March8Q9DBD2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
March8Q9DBD2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
March8Q9DBD2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
March8Q9DBD2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
March8Q9DBD2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
March8Q9DBD2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
March8Q9DBD2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
March8Q9DBD2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March8Q9DBD2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
March8Q9DBD2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
March8Q9DBD2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
March8Q9DBD2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
March8Q9DBD2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
March8Q9DBD2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
March8Q9DBD2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March8Q9DBD2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March8Q9DBD2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms