Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tysnd1Q9DBA6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms