Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med29Q9DB91 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med29Q9DB91 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med29Q9DB91 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms