Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn3Q9DAW9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms