Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DAE8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DAE8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DAE8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DAE8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DAE8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DAE8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DAE8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9DAE8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9DAE8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DAE8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DAE8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DAE8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DAE8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DAE8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DAE8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DAE8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9DAE8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms