Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9DA42 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9DA42 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9DA42 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9DA42 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9DA42 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9DA42 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9DA42 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9DA42 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9DA42 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9DA42 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9DA42 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9DA42 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9DA42 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9DA42 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9DA42 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9DA42 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DA42 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DA42 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DA42 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DA42 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DA42 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DA42 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DA42 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DA42 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DA42 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9DA42 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9DA42 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9DA42 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9DA42 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9DA42 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9DA42 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9DA42 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9DA42 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9DA42 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9DA42 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9DA42 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9DA42 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9DA42 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9DA42 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9DA42 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9DA42 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9DA42 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9DA42 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9DA42 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9DA42 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9DA42 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9DA42 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9DA42 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9DA42 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9DA42 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9DA42 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9DA42 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9DA42 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9DA42 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DA42 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DA42 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DA42 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DA42 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DA42 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DA42 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DA42 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DA42 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DA42 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9DA42 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9DA42 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9DA42 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9DA42 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9DA42 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9DA42 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9DA42 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9DA42 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9DA42 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9DA42 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9DA42 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9DA42 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9DA42 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9DA42 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DA42 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DA42 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DA42 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DA42 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DA42 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DA42 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DA42 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DA42 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DA42 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DA42 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DA42 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9DA42 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9DA42 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9DA42 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9DA42 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9DA42 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9DA42 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9DA42 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9DA42 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9DA42 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9DA42 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9DA42 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms