Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samd8Q9DA37 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd8Q9DA37 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms