Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA17

Tsga13, Testis-specific gene 13 protein, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsga13Q9DA17 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsga13Q9DA17 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsga13Q9DA17 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsga13Q9DA17 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms