Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calr3Q9D9Q6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calr3Q9D9Q6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calr3Q9D9Q6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms