Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q3

1700034I23Rik, RIKEN cDNA 1700034I23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700034I23RikQ9D9Q3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700034I23RikQ9D9Q3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms