Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms