Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp12Q9D9M2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Usp12Q9D9M2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp12Q9D9M2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp12Q9D9M2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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