Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms