Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Speer4bQ9D9F7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms