Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmco5aQ9D9D5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms